LAMMPS分子動力學核心技術實戰培訓班
各企事業單位、高等院校及科研院所：
分子動力學模擬被廣泛用于生命科學、化學工程、物理、醫藥、材料科學等領域。由于傳統實驗需要大量的人力物力而且耗時，而計算機模擬的方法省時省力，能有效提高科研效率；目前，分子動力學模擬能在很大程度上進行預測指導實驗，因此模擬與實驗的對照是將來研究的主要方向之一。分子動力學模擬作為一種理想的計算機模擬方法，可以用來模擬兩相之間的相互作用，也是對計算和實驗的補充。
應廣大學員要求，中國管理科學研究院職業資格認證培訓中心（http://www.cnzgrz.org.cn/）特舉辦“LAMMPS分子動力學核心技術實戰培訓班”本次培訓主講內容圍LAMMPS分子動力學核心技術開展，以實際科研工程中典型的實例為主線，對前沿的分子動力學模擬計算方法及應用進行了全面的講解，同時進行深入的案例分析，幫助學員掌握和利用LAMMPS這一軟件平臺進行仿真計算與產品的研發工作。
本次培訓由北京中科軟博信息技術研究院和北京中際英才文化傳媒有限公司具體承辦，相關事宜通知如下：
一、課程目標：
1. LAMMPS分子動力學理論與軟件操作培訓，邊講解邊實踐操作。
2. 通過本課程的學習，學員熟練掌握LAMMPS分子動力學的原理、方法、軟件操作。
3. 學員基本具備獨立完成LAMMPS分子動力學的論文及實際科研工程的能力。
二、課程特色:
1. 資深專家深入講解LAMMPS分子動力學相關理論和操作技能；由淺入深、從理論到實踐全面解析；
2. 專家學員互動、答疑解惑、分享經驗；專家推薦經典學習書籍、網絡資源等。
3. 由淺入深帶你吃透LAMMPS分子動力學，掌握理論知識點及實踐訣竅，理論與上機實操培訓相結合，學習效率有保證。
三、時間地點: （遠程在線培訓和現場培訓同時進行，大家可以自由選擇）
2020年10月23日—— 2020年10月26日 遠程直播課程
2020年10月23日—— 2020年10月26日 北京（現場培訓）
（時間安排：第一天報到、授課三天、大學機房授課）
四、參會對象：
本次培訓課程針對全國高校及各省市、自治區從事材料科學、分子模擬、力學、生物與醫學、化學與化工、機械與自動化、物理、能源與環境等相關的科研單位技術骨干、科研院所研究人員和高等院校相關專業教學人員及在校研究生、碩士、博士等相關人員，以及分子模擬計算的廣大愛好者。
五、培訓課程大綱
一、Lammps基礎與原理
MD模擬的基本邏輯思路
Lammps軟件學習框架
Lammps研究的幾方面重要資源
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1，linux系統簡介，常用基礎命令操作講解
2，分子模擬的發展歷史、分子模擬的優勢和局限
3，分子模擬的基本框架：建模（前處理）、采樣（模擬）、分析（后處理）
4，基本動力學方程：分子動力學的基本假設和理論框架
5，數值算法：分子動力學常用的數值算法及選擇它們的理由
6，運動方程/邊界/截斷/長程作用/系綜/控溫控壓等一系列基本概念介紹
7，力場（經驗勢函數）：如何針對不同系統選用不同的勢函數，此部分為分子動力學的核心。同時還會介紹一點MD的GPU計算相關內容。
8，模擬-理論-實驗三者之間的關系及其在lammps模擬中的體現和模擬注意事項
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二、In文件的基本邏輯框架、基本命令
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1，用 LAMMPS操作完成Lennard-Jones melt問題的分子動力學模擬
2，了解in文件的基本結構及其邏輯安排
3，學習最常用的lammps命令，包括有序結構初始構型的建立方法、時間步長的設置、構型的輸出
4，通過ovito、VMD可視化軟件來看動畫做圖片以及結構分析等。
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三、Lammps建模與進階
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1，學習data文件的結構以及編寫方法和注意事項
2，學習有序晶體結構的建模方法
3，學習用VMD、packmol、Moltemplate、MS軟件、topotool命令來建立涉及水、碳管、石墨烯、高分子鏈、復合系統等無序體系的初始構型，并導出lammps能用的data文件的方法。
4，通過具體的練習，親自操作，加深學員對于這些軟件、方法的掌握。
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四、用Lammps模擬具體物理問題（應用中存在的問題）
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1，用 LAMMPS操作完成 crack、shear、flow、friction等問題的分子動力學模擬，并將結果利用VMD、OVITO軟件進行可視化。
2，學員在此階段可進一步學習LAMMPSin文件的編寫及可視化軟件VMD的使用，制作精美圖片、動畫。
3，通過練習，學員親自上機實踐，加深對lammps關鍵命令的理解；
4，了解關鍵命令應用中的一些注意事項。
5，模擬中出現錯誤后的調試思路；
6，分階段模擬復雜物理問題的技術方法；
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五、用Lammps輸出研究所需要的數據信息
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1，利用LAMMPS完成melt, crack問題的研究，并分析模擬所得結果。
2，運用lammps對系統施加不同力學載荷、模擬磁場、電場以及控溫、控壓等操作的實現；
3，結構優化、動力學優化的設置；
4，學習用lammps輸出分析所需要的系統不同層次的信息的方法；
5，進一步講解VMD、OVITO在模擬結果分析中的作用。
6，進一步學習金屬體系、高分子體系、水分子團、reaxff化學反應等的模擬設置；
6，Lammps模擬中各種變量的設置；
7，通過具體的練習加深對lammps施加不同載荷的命令的理解。
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六，Lammps大量實例練習賞析（已發表文章）
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1，大量全原子分子動力學模擬、粗粒化分子動力學模擬實例講解。
2，通過多個實例的演示學習，加強學員對lammps模擬中數值模型的建立、主要文件的編寫、系統平衡、時間步長選擇、出錯調試、多命令組合實現復雜功能等等一系列重要問題的認識
3，基于GPU的MD計算軟件HOOMD介紹，與lammps的異同。
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七、LAMMPS高級研修及案例操作
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通過大量的實例學習Lammps MD編程語言的基本結構、基本命令，改造經典問題的in文件解決自己的問題
1. Lennard Jones melt
2. Obstacle
3. crack
4. flow
5. friction
6. micelle
7. shear
8. 基底應變梯度驅動納米滑塊運動（Scientific reports）
9. 碳納米管從高分子基體中的拔出行為模擬
10. 碳納米管粗粒化模擬(ACS Macro Letters, Carbon, Comptes Rendus Mecanique)
11. 碳納米管自組裝的全原子模擬J. Phys. Chem. C.
12. 含有缺陷的碳納米管、石墨烯自主裝模擬NANO RESEARCH
13. 金屬表面能計算Comp. Mater. Sci.
14.石墨烯泡沫材料的變形行為 （Carbon,ACS Nano）
15. 水在石墨烯層中的流動（PRE, ACS Applied Materials & Interfaces, Langmuir）
16. 黑磷結構的模擬
17.銅納米線拉伸模擬
18.石墨烯在粗糙銅表面的粘附
19.碳管-硅復合材料模擬
20. 分子篩納米膜分離H2/CO2混合氣體模擬
21. 環氧樹脂的模擬
22.金屬有機框架的模擬
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八、輔助課程
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1.其他相關軟件的功能介紹，如GROMACS、VASP、NAMD、MS等
2.建立微信群QQ群，建立長期技術問題答疑平臺
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六、費用標準：
A類，每人3900元（含培訓費、資料費、證書、午餐費）住宿可統一安排，費用自理。
B類，每人4580元（含培訓費、資料費、證書、午餐費）住宿可統一安排，費用自理。
七、頒發證書：
參加相關培訓并通過考試的學員，可以獲得：
A類，中國管理科學研究院職業資格認證培訓中心頒發的《LAMMPS分子動力學應用工程師》（高級）專業技能證書，官方網站查詢，該證書可作為有關單位專業技術人員能力評價、考核和任職的重要依據。
B類，工業和信息化部全國網絡與信息技術考試管理中心頒發的《LAMMPS分子動力學》職業技能證書，官方網站查詢，該證書直接納入專業人才數據庫。（加上A類共兩本證書）。
注：請學員帶兩寸彩照兩張（背面注明姓名）、身份證復印件和學歷證明復印件各兩張。
八、聯系方式：
聯系人：李子康 手機（微信同號）：17777851320
電 話：010-56129268 網址：http://www.cnzgrz.org.cn
E_mail：l_zk01@163.com 官方QQ：3255984613
lammps分子動力學QQ群號753267868 （加群備注：李子康邀請）
參加過培訓的學員單位及研究方向：（部分）
單位及高校
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研究方向
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清華大學
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水分子模擬計算、
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清華大學
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核研院-金屬材料輻照效應
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北京科技大學
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鋁的凝固過程、膜分離
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中國石油天然氣股份有限公司
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重整與芳烴研究室-催化劑
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新疆大學
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機械工程學院、腐蝕
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上海海洋大學
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沖擊波和物質相互作用，相變模擬，x射線吸收譜
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蘭州大學
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粒子與材料表面相互作用過程
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華中師范大學
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二維碳材料、二氧化鈦
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西安交通大學
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能源與動力工程學院、吸附與脫附
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中國科學院工程熱物理研究所
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儲能-超臨界流體
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復旦大學
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圖像處理、機器學習、數字科學
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西安科技大學
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能源轉化與儲存、聚合物分子動力學
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北京科技大學
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PDCL薄膜的微宏觀力學性能
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武漢大學
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視頻信息處理、語義分割
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東北石油大學
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油田化學、硅鋁酸鹽分子模擬
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華中科技大學
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高分子自組裝
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浙江大學
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黏土與溶液相互作用
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成都理工大學
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油田化學及提高采收率
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北京科技大學
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鋼渣固碳（CCS）
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東北石油大學
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原油乳狀液界面膜性質
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上海理工大學
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微納米相變材料
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北京科技大學
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分子動力學與斷裂失效
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北京工業大學
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電極材料對離子液體的影響
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天津大學
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油砂分離
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北京理工大學
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金屬及合金材料熔化及凝固過程
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北京化工大學
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橡膠納米復合材料機械性能
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吉林大學
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氧化物液固轉變形核路徑選擇機制與調控
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